Af en toe kan het herpesvirus veel ernstigere verschijnselen geven. Er zijn 2 vormen: de abortus vorm en de neurologische vorm.
Bij de abortus vorm aborteert de merrie. Meestal gebeurt dit in de laatste 4 maanden van de dracht. Vaak wordt een fris maar dood veulen in de vruchtvliezen geboren. Soms, als de merrie de dracht bijna volbracht heeft, wordt een levend veulen geboren maar deze kunnen zeer zwak zijn en hebben een slechte kans om te overleven. Herpesvirus is de belangrijkste oorzaak van abortus bij het paard. De merrie heeft bijna nooit klachten, vaak wordt ze weer makkelijk drachtig en kan goed het volgende jaar een gezond veulen krijgen.
De neurologische vorm is zeldzamer dan de abortus vorm. Paarden kunnen deze neurologische vorm krijgen omdat ze besmet worden door een ander paard met herpesvirus maar ook doordat ze zelf al langere tijd besmet zijn en het virus weer actief wordt. Soms krijgt maar 1 paard klachten maar soms krijgen meerdere paarden op bijvoorbeeld een stal klachten. De klachten beginnen met koorts, het virus tast vervolgens het ruggenmerg aan. De symptomen hangen af van waar het virus het ruggenmerg aantast. De meest geziene symptomen zijn zwakte van de achterhand en staart, ataxie en zelfs verlamming. De symptomen beginnen vaak heel plotseling en verergeren binnen enkele dagen. Zolang paarden nog zelf kunnen blijven staan is de prognose redelijk. Paarden die niet meer zelf kunnen staan moeten vaak geëuthanaseerd worden omdat ze te ernstige complicaties hebben.